帕多瓦植物園之所以列入世界遺產，是因為它本來就是為科學而設的機構，而且原始功能至今仍在延續。植物園創建於 1545 年，是世界第一座大學植物園，也是現存最古老的同類型花園。UNESCO 重視它對義大利及歐洲植物園發展的影響，也重視它見證植物、思想與知識的交流。因此，這裡不只是歷史花園，同樣也是科學與教育遺產。

空間格局讓這種性質清楚可見。中央圓形區象徵世界，外圍環繞代表海洋的水道；圓形之內有一個刻字的大方形，再由依四方位排列的道路分成四個單元。後來增建的裝飾性入口、欄杆、抽水設備與溫室，並未抹去原始布局。它的幾何秩序，與卡塞塔戲劇性較強的景觀設計，以及考古遺產中的耕作環境，都形成鮮明對比。

可從結構與收藏的關係理解這座花園。超過 6,000 個物種依系統性、實用性、生態環境及主題分類配置；園內還有超過 50,000 冊書籍與手稿的圖書館，以及被形容為義大利第二大規模的植物標本館。植物園的工作對植物學、醫學、生態學與藥學有所貢獻，而持續進行的研究、教學與科學傳播，保存了它最初的用途。後來的修復尊重原有特色與材料，整體仍保有高度的結構與功能連續性。